Den största skillnaden är skillnaden i det aktiva materialet. Det aktiva materialet i sekundärbatteriet är reversibelt, medan det aktiva materialet i primärbatteriet inte är reversibelt. Självurladdningen av det primära batteriet är mycket mindre än det för det sekundära batteriet, men det interna motståndet är mycket större än det för det sekundära batteriet, så belastningskapaciteten är lägre.
Dessutom är den massspecifika kapaciteten och volymspecifika kapaciteten för primärbatteriet större än vanliga uppladdningsbara batterier.